一、DNA基因分析类软件
1、SnapGene是一款功能强大的DNA序列分析软件，使用能够帮用户分析和修改DNA图谱并将它们导出到其他格式，支持分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒原件，生成详细的DNA序列文件。
2、DNAstar是一款专业的dna分析软件，其主要是用作DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理等生物综合性序列分析。
3、DNAman是一款专门用于开发的高度集成化的分子生物学应用软件，几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作，拥有多种分析功能，列如多序列比对、蛋白质分析、限制性酶切分析、质粒绘图、PCR引物设计等。
4、AgilentGeneSpringGXV11.5是一款广受好评的基因组学工作人员必知软件，使用者可在短时间内分析运算出目的基因的序列，称得上系统生物学分析软件中的佼佼者，受到相关科研工作者的欢迎和肯定。
5、vectorntiadvance是一款生物工程软件，软件包含了丰富的模块，可以满足不同生物研究人员和学习人员的需要。vectornti11可以针对DNA、限制酶、引物分析、蛋白质等类型的生物数据进行详细模拟和演化分析等操作，可以有效地对各类生物元素进行有效细致地分析，还可以生成点阵关系图，是您管理、查看、分析、转换分子生物学数据的好帮手。
6、primerpremier是一款基因分析软件,其是专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计和评估程序。其包含序列编辑窗口、引物设计窗口、酶切分析窗口和纹基分析窗口四个界面窗口，其分别为用户提供引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA基元查找和同源性分析功能。
7、TreeStarFlowJo是一款功能强大的流式细胞数据显示分析软件，基于流式细胞的荧光发射提取表型和细胞特性。该程序能够将聚合数据显示为一维，二维或三维直方图。测量标度通常是高精度的对数。这项技术在健康障碍，尤其是癌症的研究中有许多应用。因此，在计算机上分析这些数据会自动使研究人员绘制出三维图。该计划可用于研究和临床目的，并提供有用的工具和能力在各个领域。
二、医学影像类软件
1、Mimics是一款非常专业的交互式的医学影像控制系统，全称为“MaterialiseMimicsInnovationSuite”，是一种医学影像控制系统。它支持多核运算，输入各型CT、MRI等设备扫描的数据，进行三维重建、输出转换、表面网格划分、体网格划分及其它处理。
2、MediaCyberneticsAutoQuant是生命科学业界领先的高级图像反卷积、3D展示软件。从您使用最完整的套件的2D和3D复原算法可用，包括业界最佳盲解卷积算法的图像检索更好的数据。全世界的显微镜专家相信AutoQuant的准确性和其令人惊叹的定量结果。
3、FEIAmira是一款功能强大的专业可视化和三维重构软件，常用于可视化操作、生命科学研究和了解来自于计算机断层扫描、显微镜、MRI及许多其他成像形式的数据。它能够识别生命科学、生物医学的数据来源、方式及类型，提供XBioFormats、XNeuro、XMolecular、XImagePAQ、XMesh等多种可视化技术和交互操作功能。
4、ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件。一款功能强大的图像处理软件，在科研中应用极为广泛。
5、imageproplus是一款功能强大的图像处理软件，并可对图片进行深度分析，其被广泛应用2D、3D图像的处理、增强和分析等操作。软件内置3D成像工具，允许用户直接应用3D滤镜，该滤镜采用了最为先进的基于运算单元的真三维像素3D滤镜，同时用户能够直接使用内置的OpenGL3D浏览器来进行交互式的3D体渲染。
6、BiplaneImaris是为用户提供3D和4D显微数据集的可视化，分割和解释所需的全部功能。结合速度，精度和易用性，Imaris提供了一套完整的功能，可处理任意尺寸（从几兆字节到几千兆字节）的三维和四维多通道图像。方便地加载，处理和可视化从几乎任何共焦和宽视场显微镜采集的图像，从图像数据中获得全新且具有开创性的洞察力。
三、分子、药物、引物类软件
1、oligo是一款著名的引物设计软件，主要用来设计和分析序列和PCR引物，合成基因和各种探针，包括小分子干扰核苷酸和分子信标的工具。程序具备基于最近邻热力学数据，低聚糖的搜索算法寻找最佳引物PCR，包括TaqMan、高度多路复用，共识或简并引物，支持多个文件的批处理，适合于生物学中的应用。
2、SchrodingerSuites薛定谔软件，是一款药物设计软件，主要为生命科学和材料科学的所有分支提供完整的解决方案和服务。该产品包括从分子建模到药物设计和制造的一系列工具和程序。该软件并不是独立，而是一个软件合集包，由maestro、maesrtoelements、materialsscience、bioluminate、knime、canvas、mmshare、aacg、Glide、Impact、Jaguar等软件组合而成，同样也是目前非常专业优秀的分子建模，药物设计和材料科学软件。
3、PyMOL是款功能比较全面的三维分子模型软件；采用可视化的操作方式，支持对图像格式也相当的广泛，而且可以让用户完成对分子动画创建。
4、TriposSybyl是为药物小分子与生物大分子科学领域研究者所设计分子模拟软体。模拟的内容包括了药物小分子的建模、构象分析、三维定量构效关係研究、药效团建模、虚拟筛选、生物大分子的同源模建、活性位点分析、数据库搜索等。
5、MDIJade是专门用于XRD分析的软件，XRD分析就是X射线衍射分析，MDIJade通过对材料进行X射线衍射，分析其衍射图谱，获得材料的成分、材料内部原子或分子的结构或形态等信息的研究手段。
四、解剖学类软件
1、HumanAnatomyAtlas是一款取自透视人体VisibleBody的一款全新应用程序，应用将个高质感的3D模型展现给读者，可旋转可缩放，并对位置、形态、功能和生理结构进行注解。
2、3DBody是一款人体解剖三维交互式软件，它拥有最完整全面的解剖学数据，涵盖了人体所有解剖系统。
五、统计分析类软件
1、IBMSPSSStatistics是一款专业的数据统计分析软件，在调查统计行业、市场研究行业、医学统计、政府和企业的数据分析应用中都是久享盛名的统计分析工具，具有完整的数据输入、编辑、统计分析、报表、图形制作等功能。
2、SmartPLSProfessional3.2.8专门从事结构方程（SEM）建模领域。使用该软件，您只需一分钟即可完成PLS-SEM。
3、medcalc19是专为医学工作者制作的一款医学统计软件，利用该软件可以快速帮助用户进行常用的医学计算和ROC曲线(受试者工作特征曲线)分析，其中包括所有可能阈值的敏感性，特异性、预测值与患病率的关系图、数据绘图、区间似然比等多种模块信息。
4、PASS是一款功能强大的样本量和功率软件，临床试验，制药和其他医学研究的领先样本量软件选择。它还成为所有其他需要进行样本量计算或评估的领域的支柱。使用为用户提供妥善的解决方案，并且是确定所需样本量或分析研究功效的主要软件工具。
5、ReviewManager5（RevMan5）用于制备和维护Cochrane系统评价软件，是最常用的循证医学中作系统评价和分析的软件。对录入的数据进行Meta分析，并且将Meta分析的结果以森林图等比较直观的形式进行展示。
6、Process是一款用于spss软件中的调节效应插件，专门进行分析中介效应和调节效应，Process主要应用于SPSS、SAS等传统数据统计分析软件。
7、Mplus是一种统计建模软件，为研究人员提供了一种灵活的工具来分析他们的数据。Mplus为研究人员提供了多种模型，估算器和算法选择，该程序具有易于使用的界面以及数据和分析结果的图形显示。
8、IBMSPSSAmos是一款功能强大的结构方程（SEM）建模软件，软件旨在帮助用户快速的对复杂变量关系进行假设，并进行研究，从而从数据中获得更多的线索和信息，支持各种标准的多变量分析方法，如回归、因子分析、相关分析以及方差分析等。
9、GraphPadPrism版是一款适用于医学绘图软件，专为科学研究而设计，加入世界领先的科学家研究方法，能够让用户在短时间内做出最合适的分析选择，并优雅地绘制和展示您的作品。
10、NCSS是一款功能强大的专业数据统计分析软件，使用能够帮助用户快速进行数据统计、分析和计算等操作。软件支持描述性统计、相关及回归分析、试验设计、质量控制、生存及可靠性分析、多元分析、时间序列分析及预测、统计图表绘制等操作，软件同时为用户提供了一系列用于比重对比和列联表分析的准确的工具，支持批量评估。
11、UmetricsSIMCA是一款功能强大的多元变量统计分析软件，深受全球科研工作者的喜欢，它为为多元变量统计分析提供了完善的解决方案和全新的标准。旨在帮助用户快速有效的挖掘数据并解释数据结果。
12、TheUnscramblerX在多变量分析（MVA）和实验软件设计方面设立了超过25年的标准。广泛的多元回归，预测和分类方法，经典统计和统计测试，具有实时可视化和易于变换选项的交互式数据预处理。
六、文献类软件
1、endnote是一款强大的参考文献管理工具，被广泛用于学术领域。它的主要用户为研究人员、图书管理员和学生，他们可以通过在线搜索文献、建立文献库和图片库、定制文稿、引文编排、文献检索工具、文摘及全文的管理工具、引文编排工具等来做他们想做的事情。
2、NoteExpress是一款国产的专业文献管理软件。NoteExpress内嵌的浏览器可以为用户提供最简单、高效的网页数据搜集，通过简单的设定，用户就可以将网页中显示的信息，变成标准的题录。而对于筛选出来的结果，软件将根据不同研究方向分门别类，按照年份、作者、标题等排序，这样以来用户就快速的找到需要的文献，节约了阅读浏览的时间。
3、Papers是一款革命性的写论文工具，汇集了海量论文模版、格式、索引等供用户下载使用，可以在短时间内创作出精彩的文章。Papers把文献有关的各项活动流畅的组织在一起。主要功能包括包文献导入、组织、阅读（注释）、自动匹配参考条目、搜索、在文档中插入引用、评点交流等。
4、CiteSpace可视化文献分析软件，能够显示一个学科或知识域在一定时期发展的趋势与动向，形成若干研究前沿领域的演进历程，citespace将能很好的帮助大家从众多的数据中如何找到自己所需要的，从而解决哪些文献是具有开创性和标志性的问题。
5、CAJViewer阅读器，专用全文格式阅读器，支持中国期刊网的CAJ、NH、KDH及PDF格式文件阅读。软件下载地址
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