针对真菌基因组的功能分析,之前我发布了CMPP,可以在本地或者是在Google的Colab上,自动化注释真菌基因组中的碳水化合物活性酶,蛋白酶,P和参与病原-宿主相互作用的基因。在开发了Colab版后,收到了一些来自大家的反馈,考虑到Colab在大陆访问比较困难,本地运行又要安装一些依赖软件,对Linux的操作有一些门槛,所以进一步开发了一个在线APP,希望可以方便大家的使用。点击阅读原文可直达。下面简单介绍一下CMPP-WEB的用法。访问页面如下:
APP初始页面点击Startanewjob可以开启一个新任务,选择一个包含了基因组所有的蛋白质序列的fasta文件,直接上传。
上传蛋白质fasta文件服务器会根据文件内容生成一段哈希,之后想再次在线查看,可以点击Loadajob输入字符串。在没有运行结束时,请不要关闭页面,为了交互我把它做成了在线的APP,关闭页面会导致任务终止!
结果展示欢迎大家使用,并且提出宝贵意见!在此感谢雪可同学的试用反馈。
酶矿工人
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